越是精密的仪器使用中越是要注意，如果不按操作回程操作就可能造成仪器重要部分损坏影响它检测的准确性。像原子吸收分光光度计就由多个部分构成，容易出现问题的部分是进样和光源系统，仪器使用中应注意一些事情。
进样口容易被损坏或者污染，当新样品进样的时候要确保进样口没有其它物质残留，每次实验结束后用稀硝酸溶液进行清洗，光谱图中显示没有光谱值为止。还有一种原因导致进样口污染，就是样品中有容易结晶的物质，在进样的时候可能会残留在进样口处，如果不及时处理会对之后的实验造成影响，导致数据测量不稳或者线性关系不明显。在实验之前对样品进行预处理很有必要，可以使用固相萃取仪对样品进行浓缩，之后再用标准液定容稀释，以减少其它物质对实验的影响。
光源的长期使用会对阴极灯造成一些影响，如果发现光源发光不正常需要即使更换元件。有时光源位置没有调整好也会影响光谱图的清晰度，阴极灯的高度和前后位置都可以调整，在进样前需要调整一下。在仪器使用中，原子化是非常重要的过程，火焰燃烧器是否正常工作与燃气的纯净度和流量有关。如果气体发生泄露就会产生燃烧器打不着火的情况，经过一定的捡漏工作可以解决泄露问题。仪器本身也有安全警示功能，可以帮助人们快速找到故障原因。
如果标准曲线画不好，实验结果就不会准确，在标准液配置过程中要注意不要引入新的成分，通过定容来控制它的浓度。在正式实验之前需要再冲洗一下机器，避免标准液中的残留成分影响样品检测。仪器使用一段时间需要做空白实验来调零，减少实验误差。