如果是对市场上的离子色谱对比，就会发现它的性能也有很大的差异，不但其在功能上有很大的差异，而且其在分析之时也有很大的性能差异，有些在分析之时能有更好的适应性，一些在分析之时也有很好的速度，但是有些就没有这方面的优势。之所以这种产品有很大的性能差异，也是有多方面原因的。
首先就是因为生产商在生产中诮设计上面的不同，不同的厂家会有不同的设计实力，而且不同的厂家会有不同的设计理念，就会让产品在使用之时有很大的差异。有些厂家偏重于一种对象的分析和测定，有些厂家在分析之时偏重于它的全面性，正是因为这样，就会让它的整个分析有很大的性能差异。而且在不同的设计之下，也会让它的操作有很大的性能差异。
有些厂家的制备色谱设备在分析之时有更好的操作方便性，但是有些就在操作上相对麻烦一些。而且其在生产中，不同的厂家也会有不同的技术实力，想要让这种仪器有更好的工作性能，也就需要有更好的技术，只有高技术之下，才会让它有更好的质量。所以相对来说，这方面也是十分重要的，但是因为技术是实力，有些厂家没有这方面的实力。
除了上面所说的之外，不同的厂家也有不同的生产心态。必然要说明一点，想要让这种仪器在使用之时有更好的性能，就必然要让它的生产成本有一定的提高，有些厂家在生产中就舍不得成本，不但在各种组装及零件处理上没有工艺性，而且也在材料及零件上没有更好的质量保证，而在这样的情况下也没办法让产品有更好的质量，所以它是不是有更好的性能，也受到厂家的生产心态影响。