在开具专用当月，发生销货退回、开票有误等情形，收到退回的联、抵扣联符合作废条件的，按作废处理；开具时发现有误的，可即时作废。
专用开具后，如发生销货退回、开票有误、应税服务中止以及抵扣联、联均无法认证等情形但不符合作废条件，或者因销货部分退回及发生销售折让，可以开具红字专用。
专用尚未交付购买方或者购买方拒收的，或购买方未用于申报抵扣并退回联及抵扣联的，销售方在系统升版中填开并上传《信息表》。
专用已交付购买方，且购买方已认证抵扣或未认证无法退回的，购买方可在系统升版中填开并上传《信息表》。
系统自动校验通过后，生成带有“红字信息表编号”的《信息表》，并将信息同步至纳税人端系统中。
销售方凭税务机关系统校验通过的《信息表》开具红字专用，在系统升版中以销项负数开具。红字专用应与《信息表》一一对应。
目前纳税人使用的系统升版中，可以实现的全部操作，纳税人一般不用到实体办税服务厅办理。
专用开具后，在邮寄等过程中可能发生丢失的情况，对购货方的认证抵扣带来影响。可以根据下面的不同情况分别操作。
1.丢失已开具专用的联和抵扣联，丢失前已认证相符的，购买方可凭销售方提供的相应专用记账联复印件及销售方主管税务机关出具的《丢失专用已报税证明单》（简称《证明单》），作为进项税额的抵扣凭证。专用记账联复印件和《证明单》留存备查。
2.丢失已开具专用的联和抵扣联，丢失前未认证的，购买方凭销售方提供的相应专用记账联复印件进行认证，认证相符的可凭专用记账联复印件及销售方主管税务机关出具的《证明单》，作为进项税额的抵扣凭证。专用记账联复印件和《证明单》留存备查。
4.丢失已开具专用的抵扣联，丢失前未认证的，可使用专用联认证，专用联复印件留存备查。
5.丢失已开具专用的联，可将专用抵扣联作为记账凭证，专用抵扣联黄菊内幕复印件留存备查。
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